Durante la mañana de la jornada electoral se registraron diversas incidencias en las casillas especiales, en las cuales solo había 750 boletas disponibles.
Uno de los incidentes ocurrió en la casilla especial en Hospital General en la Ciudad de México, a la llegó el exgobernador Fidel Herrera en sillas de ruedas y trató de ser el primero en votar, por lo que los ciudadanos que llevaban horas formados, comenzaron a abuchearlo.
Otro de los incidentes ocurrió en una casilla de Periférico, en la que ciudadanos bloquearon la avenida cuando se acabaron las boletas; misma situación ocurrió en calzada de Tlalpan.